A partir del 31 de agosto del 2001, el Estado peruano reconoce legalmente la existencia de una agricultura orgánica en el país, brindándole la oportunidad de iniciar una nueva etapa para generar leyes, lineamientos y normas que favorezcan los mecanismos de control y la promoción de la agricultura orgánica a nivel nacional e internacional.

De la misma manera, el Perú se coloca al nivel de los principales países del mundo que ya cuentan con una legislación sobre la agricultura orgánica, lo que permitirá incentivar los mecanismos para mejorar el acceso a mercados locales e internacionales y contribuir de manera decidida con el desarrollo sostenible y la lucha contra la pobreza.

Actualmente, se cuenta con el Reglamento técnico para la producción orgánica, emitida en enero del 2003. El Reglamento norma la producción, transformación, comercialización y proceso de certificación de los productos orgánicos y permitirá que los ciudadanos ejerzan su derecho a exigir que los productos etiquetados o denominados como 'ecológico', 'orgánico', 'biológico' o 'biodinámico' posean la respectiva certificación.

El SENASA es la Autoridad Nacional Competente en producción orgánica, por Decreto Supremo N° 005-2004-AG, de febrero del 2004. La Autoridad Nacional Competente velará por la correcta aplicación del Reglamento técnico para la producción orgánica/ecológica.

La Comisión Nacional de Productos Orgánicos - CONAPO es el ente asesor y consultivo del Ministerio de Agricultura en la temática de la agricultura orgánica o ecológica. Es una instancia de concertación donde participan entidades públicas y privadas cuyo principal objetivo es favorecer el desarrollo de la producción orgánica/ecológica en el país. Sus miembros son:

- Ministerio de Agricultura - MINAG (quien preside la CONAPO)
- Comisión para la Promoción de Exportaciones - PROMPEX
- Instituto Nacional de Recursos Naturales - INRENA
- Instituto Nacional de Investigación y Extensión Agraria - INIEA
- Servicio Nacional de Sanidad Agraria- SENASA
- Instituto Nacional de la Defensa de la Competencia y Protección de la Propiedad Intelectual - INDECOPI
- Universidad Nacional Agraria La Molina - UNALM
- Red de Agricultura Ecológica del Perú - RAE Perú
- Asociación Nacional de Productores Ecológicos - ANPE Perú
- Agencia Suiza para el Desarrollo y la Cooperación - COSUDE
- Consejo Nacional del Banano Orgánico
- Consejo Nacional del Café

Funciones de la CONAPO:

- Brindar asesoría al Ministerio de Agricultura y al SENASA, en su calidad de Autoridad Competente, en la temática de producción orgánica.
- Diseñar, elaborar y proponer lineamientos y normas generales orientados al ordenamiento legal, a la promoción y al fomento de la producción orgánica en el país.
- Ser el órgano oficial encargado de revisar periódicamente el Reglamento Técnico de Productos Orgánicos y proponer al MINAG las actualizaciones que requiera, asegurando que todas las partes interesadas puedan dar su opinión.
- Promover la difusión del Reglamento Técnico y el Plan Nacional de Fomento en todas las regiones.